根据近年来国内外农业生物技术领域的发展趋势，结合自身的基础和特色，围绕云南特有农业生物资源的生物技术研究与应用，形成上、中、下游衔接配套的三大学科方向。

实验室主要研究方向

• 作物种质资源

特色资源优异基因发掘利用研究；

特色农作物资源基因组学研究；

优质、抗病分子机理研究。

• 作物生物技术育种

开展主要农作物及生物质能源作物的抗病、抗逆和品质改良基因工程育种；

完善细胞工程育种及应用技术体系。

• 应用植物病毒

云南植物病毒基因库的建立及其应用；

植物病毒地理生态种群进化机制；

重大植物病毒病的发生流行监测与防控；

应用“植物——病毒”复合体模型筛选新型天然抗病毒活性物质。